Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL2Q969S2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL2Q969S2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL2Q969S2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL2Q969S2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL2Q969S2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL2Q969S2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL2Q969S2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL2Q969S2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL2Q969S2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEIL2Q969S2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEIL2Q969S2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms