Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms