Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKD2Q969F2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms