Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PRG4Q92954 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms