Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms