Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN4Q92575 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms