Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCSTNQ92542 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms