Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHC3Q92529 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHC3Q92529 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHC3Q92529 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC3Q92529 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC3Q92529 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC3Q92529 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC3Q92529 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC3Q92529 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC3Q92529 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC3Q92529 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC3Q92529 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC3Q92529 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC3Q92529 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms