Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSPC1Q8WXF1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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