Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms