Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJA4Q8WW22 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms