Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DEPDC1BQ8WUY9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DEPDC1BQ8WUY9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1BQ8WUY9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DEPDC1BQ8WUY9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DEPDC1BQ8WUY9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms