Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GIPC3Q8TF64 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GIPC3Q8TF64 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms