Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY5

CREB3L4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L4Q8TEY5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CREB3L4Q8TEY5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3L4Q8TEY5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms