Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3RF3Q8TEJ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3RF3Q8TEJ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3RF3Q8TEJ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH3RF3Q8TEJ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH3RF3Q8TEJ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH3RF3Q8TEJ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH3RF3Q8TEJ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3RF3Q8TEJ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3RF3Q8TEJ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms