Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEST2Q8NFU1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms