Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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