Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PIK3C3Q8NEB9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms