Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms