Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRYD3Q8NCJ5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms