Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPC24Q8NBT2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPC24Q8NBT2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms