Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms