Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ANKRD53Q8N9V6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD53Q8N9V6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms