Protein–RNA interactions for Protein: Q8N715

CCDC185, Coiled-coil domain-containing protein 185, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC185Q8N715 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC185Q8N715 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC185Q8N715 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC185Q8N715 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC185Q8N715 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC185Q8N715 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC185Q8N715 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC185Q8N715 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC185Q8N715 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC185Q8N715 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms