Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMCO5AQ8N6Q1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMCO5AQ8N6Q1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMCO5AQ8N6Q1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMCO5AQ8N6Q1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMCO5AQ8N6Q1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMCO5AQ8N6Q1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
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TMCO5AQ8N6Q1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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TMCO5AQ8N6Q1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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TMCO5AQ8N6Q1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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TMCO5AQ8N6Q1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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TMCO5AQ8N6Q1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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TMCO5AQ8N6Q1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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TMCO5AQ8N6Q1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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TMCO5AQ8N6Q1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMCO5AQ8N6Q1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMCO5AQ8N6Q1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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