Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CMTR1Q8N1G2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTR1Q8N1G2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms