Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms