Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL3Q8IVW4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms