Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC49Q8IUZ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC49Q8IUZ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms