Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
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RAB11FIP4Q86YS3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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RAB11FIP4Q86YS3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
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RAB11FIP4Q86YS3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
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RAB11FIP4Q86YS3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB11FIP4Q86YS3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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