Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LCA5Q86VQ0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms