Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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