Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG4DQ86TL0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms