Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6K3

PTAR1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAR1Q7Z6K3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTAR1Q7Z6K3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTAR1Q7Z6K3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms