Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRGAP1Q7Z6B7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP1Q7Z6B7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms