Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms