Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3BQ7Z3V4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms