Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC11Q7Z392 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC11Q7Z392 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms