Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HECW1Q76N89 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HECW1Q76N89 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
HECW1Q76N89 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms