Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IKBIPQ70UQ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms