Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA0408Q6ZU52 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA0408Q6ZU52 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA0408Q6ZU52 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA0408Q6ZU52 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA0408Q6ZU52 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA0408Q6ZU52 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA0408Q6ZU52 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA0408Q6ZU52 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA0408Q6ZU52 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA0408Q6ZU52 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms