Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
UBR3Q6ZT12 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBR3Q6ZT12 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms