Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC141Q6ZP82 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms