Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDZRN4Q6ZMN7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms