Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX2Q6XYB7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms