Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG3Q6UXM1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms