Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL17Q6UXB2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL17Q6UXB2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms