Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms