Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO3Q6UWJ1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms