Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms